《美國腦科學計劃2.0》:通過推動創(chuàng)新型神經(jīng)技術(shù)開展大腦研究
以下文章來源于創(chuàng)新研究 ,作者創(chuàng)研報告
編者按:美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)于2014年啟動了“通過推動創(chuàng)新型神經(jīng)技術(shù)開展大腦研究(BRAIN)計劃”,2019年正處于該計劃的中間階段。迄今為止,這種大規(guī)模的資源和時間投入在探索大腦方面已經(jīng)取得了重大進展。鑒于技術(shù)的顯著進步,神經(jīng)科學領域?qū)眠@些新技術(shù),進一步研究已知的最復雜的實體之一:人類的大腦,之前完成的計劃被稱為“BRAIN 1.0”。美國國立衛(wèi)生研究院于2018年4月成立腦科學計劃2.0工作組,并與2019年6月將報告《美國腦科學計劃2.0》提交給美國國立衛(wèi)生院咨詢委員會。而“BRAIN 2.0”代表了從2020年開始到2026年結(jié)束的即將進行的計劃。
一、計劃背景
2013年4月,美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)認識到許多科學問題和倫理問題與BRAIN 計劃相關(guān),召集了NIH 咨詢委員會的BRAIN 工作組,制定了以實現(xiàn)BRAIN 計劃的科學性、倫理性愿景為目標的戰(zhàn)略路線圖(BRAIN 2025:科學愿景)。從2018年4月開始,新的BRAIN 工作組回顧了之前BRAIN 計劃的投資和進展,并向更廣泛的神經(jīng)科學界和BRAIN 計劃利益相關(guān)者尋求建議?!癇RAIN 2.0”反映了BRAIN 工作組的分析和建議,在BRAIN 2025戰(zhàn)略路線圖的短期和長期目標的背景下回顧了到目前為止的成就,確定與目標的差距和新的研究機會,并提出短期研究和長期研究的目標建議。
二、重點研究領域
(一)發(fā)現(xiàn)多樣性
由于高通量技術(shù)和分析方法的進步,該領域的進展比預期的要快。但是目前迫切需要技術(shù)來實現(xiàn)有效適用于人類和其他非人的靈長類動物(Non-Human Primate,NHP)的大腦的細胞類型特異性靶向方法。除此之外,還要找到有效適用于其他傳統(tǒng)生物(如老鼠)的神經(jīng)科學的細胞類型特異性靶向方法。
1. BRAIN 2.0 短期目標建議:
(1)為細胞類型建立數(shù)據(jù)生態(tài)系統(tǒng),以便整合神經(jīng)元表型的不同方面。
(2)建立統(tǒng)一的腦細胞類型分類。
(3)實現(xiàn)對多物種細胞類型的遺傳和非遺傳操作。
(4)利用細胞普查數(shù)據(jù)更新和測試神經(jīng)回路功能的模型和理論。
(5)開發(fā)蛋白質(zhì)標簽,尤其是具有跨物種適用性的蛋白質(zhì)標簽。
(6)在保留細胞類型信息的同時,創(chuàng)建多尺度的細胞重建、連接和功能映射。
(7)將單細胞多模態(tài)分析擴展到其他物種,包括NHP和人類大腦。
2. BRAIN 2.0 長期目標建議:
(1)整合建立細胞類型數(shù)據(jù)平臺以進行理論研發(fā)。
(2)在6到10個物種中,用高粒度以及遺傳和非遺傳的途徑,進行全腦解剖解析普查。
(3)支持開發(fā)模擬人腦的三維細胞系統(tǒng)(有機體/ 組裝體)。
(二)多尺度成像
該重點研究領域的實質(zhì)性進展反映在組織處理和成像方面的顯著進步,使大腦區(qū)域和回路得到更加清晰的呈現(xiàn)。BRAIN 2.0 包括提高新工具的速度和效率;將分析擴展到更大的大腦區(qū)域;增加非神經(jīng)元細胞類型和突觸的映射;整合大腦的結(jié)構(gòu)與功能映射;在獲取和提煉數(shù)據(jù)方面的進展,得以促進跨物種的比較。
1. BRAIN 2.0 短期目標建議:
1)提高清除和標記方法的通量;開發(fā)傳播軟件和機器學習工具,有效地分析以及生成密集三維數(shù)據(jù)庫。
(2)繼續(xù)開展和擴展神經(jīng)調(diào)節(jié)作用的研究,包括微觀、中觀及宏觀尺度的研究。
(3)改進活細胞中的跨突觸順行病毒追蹤,并將病毒追蹤擴展到小鼠大腦以外的模型。
(4)在嚙齒動物和NHP 的大腦研究中,將光學成像和電生理學與功能磁共振(fMRI)方法相結(jié)合。
(5)繼續(xù)努力繪制個體動物大腦的結(jié)構(gòu)和功能圖。
(6)通過使用核磁共振(Magnetic Resonance Imaging,MRI)、其他電磁方法或者正電子放射斷層造影術(shù)(Positron Emission Tomography,PET) 從而加深對大腦微觀結(jié)構(gòu)的無創(chuàng)測量的理解。
(7)從結(jié)構(gòu)和功能測量中可重復性地描述個體大腦差異(包含整個生命周期)。
2. BRAIN 2.0 長期目標建議:
(1)在電磁水平整體評估全小鼠大腦連接體,整合死亡前獲得的體內(nèi)功能和分子這兩者之間的相關(guān)性。
(2)從功能特征明顯的個體動物的大腦中獲取完整的靈長類動物(NHP,然后是人類) 大腦投射圖。
(3)實現(xiàn)全腦、高分辨率(時空)、不受快速梯度切換和高場射頻線圈生物學限制的功能性磁共振。
(4)應用機器學習方法比較小鼠及人類大腦的同源區(qū)域。
(5)使用改進的高通量清除和標記方法,以及快速連續(xù)切片電磁工具研究人類皮層和皮下結(jié)構(gòu)。
(6)建立高通量模式,為關(guān)鍵的分子靶點(如神經(jīng)調(diào)節(jié)受體、突觸)開發(fā)和應用新型PET示蹤劑。
(7)結(jié)合載體和離體數(shù)據(jù),建立人體大腦結(jié)構(gòu)和功能之間的基本聯(lián)系,包括自然變異的作用。
(三)活動的大腦
BRAIN 2.0 的潛在發(fā)展機會包括進一步了解神經(jīng)調(diào)節(jié)功能的能力;研究較大(靈長類)大腦的工具;復雜的計算工具,以更好地評估行為(尤其是在自然環(huán)境中)。
1. BRAIN 2.0 短期目標建議:
(1)探索短期和長期行為期間不同細胞類型、神經(jīng)調(diào)節(jié)劑和神經(jīng)活動之間的實時相互作用。
(2)通過開發(fā)神經(jīng)活動的近紅外光聲兼容指標,將超聲方法與直接感知神經(jīng)活動相結(jié)合。
(3)開發(fā)新的NHP 大腦記錄和成像技術(shù)。
(4)開發(fā)新的工具用來分析原始的和后天訓練過的行為。
(5)開發(fā)新的工具用來連接某種行為,以及大腦對應這種行為的數(shù)據(jù)記錄。
(6)整合在模型系統(tǒng)之間的技術(shù)開發(fā)和信息傳遞。
(7)繼續(xù)推進電生理技術(shù)。
(8)繼續(xù)研發(fā)光學記錄技術(shù)。
(9)開發(fā)更好的記錄細胞活動的光學儀器。
(10)建立動態(tài)方法,實時檢測特定神經(jīng)肽在體內(nèi)的釋放。
(11)開發(fā)標記活躍神經(jīng)元的方法。
(12)在人類大腦回路分析的研究中,將神經(jīng)倫理學的討論和建議貫穿到整個實驗和研究過程。
2. BRAIN 2.0 長期目標建議:
(1)測量必須同時記錄的細胞數(shù)量,在給定的精度水平上解釋特定的行為。
(2)開發(fā)分析工具,建立大規(guī)模神經(jīng)群體活動和復雜行為之間的因果關(guān)系。
(3)人腦中高速神經(jīng)活動的成像。
(四)證明因果關(guān)系
BRAIN 2.0 準備在單細胞控制、納米技術(shù)和機器學習方面抓住新的研究機會。該重點研究區(qū)域旨在推出介入技術(shù),以測試結(jié)構(gòu)和功能之間的因果關(guān)系。這種方法已經(jīng)成為理解基礎復雜的生命系統(tǒng)是如何工作的基礎,并在過去的一個世紀里推動了生物學的顯著進步。
1. BRAIN 2.0 短期目標建議:
(1)建立在移動動物和深層神經(jīng)結(jié)構(gòu)中進行精確單細胞光遺傳學控制的方法。
(2)在哺乳動物中,測量以可檢測的方式改變行為所需的最少神經(jīng)元數(shù)量。
(3)測量特定的不適應行為障礙的因果回路,如成癮、社會認知障礙、攻擊性和強迫行為。
(4)擴展能夠在模型生物(嚙齒動物和果蠅)中進行復雜行為分析的機器學習算法。
(5)制定策略,對特定回路動態(tài)進行定量的、可調(diào)的實時擾動。
(6)校準擾動與自然發(fā)生的信號(大腦狀態(tài)、行為狀態(tài)、回路狀態(tài)),以測量時間和環(huán)境變化對行為的影響。
(7)結(jié)合實驗和理論,預測和控制擾動的行為后果。
(8)確定感興趣的關(guān)鍵適應性行為的因果路徑,如認知、運動規(guī)劃、感覺知覺和動物自然行為。
(9)解決遺傳擾動工具在靈長類動物身上的挑戰(zhàn),因為它們的效果遠不如嚙齒類動物。
(10)通過實時的神經(jīng)系統(tǒng)整合分析,使神經(jīng)回路操作和活動記錄之間直接關(guān)聯(lián)。
(11)將新興的擾動工具應用于目前難以通過既定技術(shù)研究的回路,例如深度和分布式腦回路。
(12)整合擾動技術(shù)與BRAIN 計劃的其它關(guān)鍵技術(shù)。
(13)支持神經(jīng)倫理學研究(概念性和經(jīng)驗性的),將神經(jīng)倫理學家納入研究團隊,以解決通過直接控制大腦回路來改變?nèi)祟愋袨樗鸬纳窠?jīng)倫理學問題。
(14)確保公平參與研究,研究結(jié)果可能波及到大量人群。
(15)闡明更接近人類生理的NHP 模型的倫理含義,隨后根據(jù)研究結(jié)果制定指導方針。
2. BRAIN 2.0 長期目標建議:
1)通過識別模型生物體中細胞的分子特性,然后繪制相應的生理和行為圖譜,跨物種來驗證進化保護,建立動物和人類之間深刻的概念聯(lián)系。
(2)將基于納米材料的技術(shù)應用于神經(jīng)回路研究,將這些技術(shù)從離體和小型應用中提取出來,應用于回路解剖的行為實驗中。
(3)基于對大腦動力學因果關(guān)系的深入理解,開發(fā)新的神經(jīng)精神疾病診斷和治療設計方法。
(4)每年將多個單細胞擾動的規(guī)模提高大約一個數(shù)量級。
(5)開發(fā)并應用聲學和磁性方法來進行擾動和讀出大腦深處的區(qū)域。
(五)確定基本原則
在生物學中,原理性的目標是創(chuàng)建實驗以觀察到概念框架,然后根據(jù)這些來建立預測模型。在神經(jīng)科學領域,對理論的需求尤為迫切,復雜性非常高。破譯大腦的可觀察屬性和大腦的底層算法,這些結(jié)構(gòu)以及它們的動態(tài)變化是理解、診斷和設計對疾病的處理方法。在BRAIN 2.0 中,將更多地關(guān)注不同類型的科學家,比如理論科學家和實驗科學家的充分合作,旨在利用實驗數(shù)據(jù)庫,以確定大腦結(jié)構(gòu)和功能的運行的基本原則。
1. BRAIN 2.0 短期目標建議:
(1)繼續(xù)開發(fā)分析大型復雜數(shù)據(jù)庫的技術(shù)
①繼續(xù)發(fā)展快速分類和編碼信息分析方法,并將規(guī)模擴大到10萬到100萬個同時記錄的神經(jīng)元。
②針對所有類型的神經(jīng)生理學數(shù)據(jù)開發(fā)實時快速可視化和信號處理的算法。
③將非線性控制理論用于實時反饋控制實驗,使用新的擾動和記錄技術(shù)來操作和分析神經(jīng)回路。
④將統(tǒng)計和分析方法與基于連接圖和細胞類型的神經(jīng)回路模型結(jié)合起來。
(2)多尺度的聯(lián)系
①在腦電圖和腦磁圖的記錄中建立大腦節(jié)律的生物物理來源,以及在更多的局部來源中建立在大腦不同區(qū)域和不同皮質(zhì)層的局部場電位。
②建立正式的統(tǒng)計推斷框架,以用不同類型的神經(jīng)科學數(shù)據(jù)進行網(wǎng)絡連接分析。
③探索融合不同實驗技術(shù)和不同時空尺度的神經(jīng)科學實驗信息的理論和統(tǒng)計框架。
④開發(fā)高維逆問題的計算效率解決方案,特別關(guān)注人類腦電圖和腦磁圖數(shù)據(jù)的解釋。
⑤發(fā)展空間尺度上的集體神經(jīng)元活動的理論和模型。
(3)識別一般原則
①對腦電回路動力學如何依賴于單個神經(jīng)元及其連接的特性進行理論研究。
②發(fā)展有關(guān)神經(jīng)元和神經(jīng)膠質(zhì)的化學活動和電活動如何編碼信息的系統(tǒng)理論;如何用這些來確定短期內(nèi)的行為;以及其如何用于適應、改進和學習更長時間尺度上的行為。
③詳細了解不同學習形式背后的大腦回路和可塑性機制。
④提出、研究和驗證某些機制,使信息能夠在特定的大腦區(qū)域之間門控、切換和傳輸。
⑤開發(fā)檢測和分類大腦內(nèi)部狀態(tài)的方法。
⑥理解關(guān)于細胞水平的神經(jīng)元活動和大腦多個區(qū)域的神經(jīng)調(diào)節(jié)是如何影響大腦主要功能的機制。
⑦繼續(xù)加強NIH BRAIN 計劃神經(jīng)倫理學工作組在倫理咨詢方面的努力,從而選擇項目或者申請人,好在適當?shù)臅r候以幫助BRAIN 計劃資助的研究人員應對與其工作相關(guān)的神經(jīng)倫理問題。
(4)加速理論、建模、計算、統(tǒng)計理念和技術(shù)在神經(jīng)科學部門和項目中的結(jié)合
①鼓勵實驗研究項目,支持與理論、計算、統(tǒng)計科學家進行簡短(3-6 個月)的探索性合作。
②支持純粹的理論或統(tǒng)計方法研究,以及小規(guī)模理論或?qū)嶒灪献鞯姆椒ā?/p>
③為理論神經(jīng)科學家量身定制新的研究生和博士后教育補助金,并加強對實驗神經(jīng)科學家定量方法的培訓。
④繼續(xù)通過夏季課程、機構(gòu)課程、基于網(wǎng)絡的課程、會議研討會和其他機制,為理論、建模、計算和統(tǒng)計學系的教師提供激勵,并支持為博士后和研究生普及推廣應用新的計算方法。
2. BRAIN 2.0 長期目標建議:
1)繼續(xù)開發(fā)分析大型復雜數(shù)據(jù)集的技術(shù)
①將統(tǒng)計和分析方法與基于連接圖和細胞類型的神經(jīng)回路模型相結(jié)合。
②將脈沖排序、編碼、連接和解碼的解決方案擴展到大于100萬個同時記錄神經(jīng)元的數(shù)據(jù)庫,并與連接組數(shù)據(jù)和其他類型的數(shù)據(jù)整合在一起。
(2)多尺度的聯(lián)系
①建立通用的框架,用于融合來自不同實驗技術(shù)、不同時間和空間尺度的神經(jīng)科學實驗的信息。
②從MRI、EEG(electroencephalogram 腦電圖) 和MEG(magnetoencephalography 腦磁圖描記術(shù))記錄中獲取實時高維反解。
③通過建立詳細的現(xiàn)實模型和定性的行為模型之間的橋梁,識別廣泛分布的、時變的神經(jīng)過程的基本要素。
(3)識別一般原則
①建立理論方法,了解適用于多種動物的微觀、中觀、宏觀回路的一般原理。
②針對一個或多個特定系統(tǒng),進行完整的計算理論研究。
(六)人類神經(jīng)科學
BRAIN 2025 的人類神經(jīng)科學部分取得了巨大的成功,但也同時揭示了復雜努力帶來的一些持續(xù)的緊張關(guān)系。成功源于技術(shù)的突破,而挑戰(zhàn)則圍繞著科學研究的人為因素,包括促進跨學科的互動,以及以富有成效的方式訪問、分析和共享數(shù)據(jù)。重要的倫理問題集中在對整合技術(shù)和可植入設備的使用上。
1. BRAIN 2.0 短期目標建議:
(1)開發(fā)更好的方法來獲取、保存和研究來自外科手術(shù)和死后樣本的活體人體組織,使對人類大腦和周圍和自主神經(jīng)系統(tǒng)的研究成為可能。
(2)增加對臨床前和臨床模型中深腦刺激(deep-brain stimulation,DBS)和閉環(huán)調(diào)節(jié)機制的理解。
(3)將研究擴展到侵入性設備之外。
(4)繼續(xù)投資于非侵入性成像儀器的物理/ 工程,并支持開發(fā)具有高時空分辨率的非侵入性方法來監(jiān)測人類的神經(jīng)活動( 包括非電活動)。
(5)為開發(fā)人類神經(jīng)科學使用的工具的團隊建立標準。
(6)支持跨學科研究,使功能磁共振成像技術(shù)在臨床環(huán)境中得以成功應用。
(7)支持神經(jīng)生物學以外的以神經(jīng)科學為導向的科學家培訓,包括計算科學家、物理學家和工程師,以推動成像和非侵入性電生理技術(shù)的進步。
(8)改善數(shù)據(jù)訪問路徑。
(9)為人類的神經(jīng)刺激和神經(jīng)調(diào)節(jié)制定一套可操作的神經(jīng)倫理指南(短期和長期)。
2. BRAIN 2.0 長期目標建議:
(1)開發(fā)更好的針對人類神經(jīng)元和神經(jīng)膠質(zhì)的技術(shù)和檢測系統(tǒng),包括改進的病毒載體、下一代CRISPR 技術(shù)和其他非病毒方法。
(2)發(fā)現(xiàn)并驗證新型PET 示蹤劑,以監(jiān)測人類突觸中的神經(jīng)活動和分子標記。
(3)改善電生理源定位,為無創(chuàng)電磁記錄帶來近乎或真正的斷層掃描能力。
(4)開發(fā)多尺度方法和工具用來結(jié)合使用不同實驗方法得到的數(shù)據(jù)。
(5)開發(fā)合適的模型來探索疾病狀態(tài)和治療機制,有助于加速其在人類中的應用。
(七)從“BRAIN 計劃”到大腦
BRAIN 2025 認識到,NIH 的BRAIN 計劃必須優(yōu)先結(jié)合互補的方法,使用完備的整合的系統(tǒng)來探索驅(qū)動更高的大腦功能的神經(jīng)元機制。重點領域1到6中列出的許多機會和目標取決于整合,這使得重點領域7在BRAIN 2.0 中有可能在幾個領域看到實質(zhì)性的提升:(1)整合細胞類型的分子、連接和生理特性的工具;(2)保留細胞類型信息的多尺度連通性和功能圖;(3)核磁共振成像與其他活動測量和解剖學聯(lián)系的結(jié)合;(4)電生理和神經(jīng)化學方法的結(jié)合;(5)擾動技術(shù)與其他技術(shù)的結(jié)合;(6)實驗與理論之間更多的互動;(7)開發(fā)方法和工具來整合來自不同實驗方法的人類數(shù)據(jù)。這些綜合方法將真正推動大腦的主動性,以理解復雜的大腦功能,如感知、情感和動機、認知和記憶,以及行動,并研發(fā)治療大腦功能障礙的新方法。
(八)科學組織
不同專家之間的協(xié)作可能具有挑戰(zhàn)性。建議采取一些積極主動的步驟,解決與科學整體組織有關(guān)的領域:
1. 數(shù)據(jù)共享
(1)來自NIH BRAIN 計劃資助項目的數(shù)據(jù)必須在同行評審期刊首次發(fā)表時公開分享。
(2)數(shù)據(jù)應該以標準格式存儲。
(3)NIH 的BRAIN 計劃數(shù)據(jù)應該存儲在NIH 維護的中央服務器上。
(4)把功勞分配給收集數(shù)據(jù)的人。
(5)元數(shù)據(jù)必須系統(tǒng)地存儲。
(6)盡可能多地存儲原始數(shù)據(jù)。
(7)數(shù)據(jù)標準應包括人們通常道德意義上可接受的數(shù)據(jù)收集、使用、存儲和訪問的標準和指南。
2. 人力資本
(1)為神經(jīng)科學吸引一定數(shù)量的專家。
(2)增強由創(chuàng)業(yè)基金資助的腦力勞動者的多樣性。
(3)NIH 創(chuàng)建并擴大支持機制。
3. 分享和使用BRAIN 計劃技術(shù)
(1)人類使用技術(shù):成立技術(shù)轉(zhuǎn)化委員會、創(chuàng)業(yè)學術(shù)科學家訓練營;繼續(xù)提高為生物醫(yī)學研究服務提供資源的能力,重點減少技術(shù)部署中的矛盾;在技術(shù)轉(zhuǎn)化中使用可預測和可持續(xù)的財務模式;解決神經(jīng)技術(shù)發(fā)展和商業(yè)轉(zhuǎn)化資源之間的不平衡;將投資擴大到侵入性設備之外;對開發(fā)人類使用的工具的團隊進行更嚴格的評估;設立BRAIN 工具交流中心;增加與聯(lián)邦機構(gòu)之間工作的透明聯(lián)系;宣傳行業(yè)和學術(shù)界的成功故事;拓展神經(jīng)倫理方面的討論。
(2)實驗室使用的技術(shù):制定可行的技術(shù)傳播路線圖;分析最合適的傳播模型;考慮為希望傳播其技術(shù)的科學家建立專門的培訓計劃;考慮在最相關(guān)的市場環(huán)境中加強創(chuàng)新者和最終用戶之間的密切協(xié)作;考慮對重要但在財政上沒有吸引力的技術(shù)進行補貼,以建立使這種技術(shù)的傳播成為可能的機制;開發(fā)替代方法,為研究人員快速采用新工具提供資金,特別是創(chuàng)新者和新的終端用戶實驗室之間的合作;基金培訓課程;支持向研究人員傳播NIH BRAIN 計劃技術(shù),以應對疾病威脅。
4. 公眾參與
(1)公民的建議能夠指導NIH 的BRAIN 計劃。
(2)作為公共資助的生物醫(yī)學研究機構(gòu),NIH 和BRAIN 計劃有責任確保其投資公平惠及所有美國人。
(3)NIH 的BRAIN 計劃應該為支持公眾參與提供資金。
5. 研究成果應惠及腦疾患者
(1)NIH 腦項目應考慮在其網(wǎng)站上列出其投資的腦項目之外的新資助機會。
(2)NIH 神經(jīng)科學生態(tài)系統(tǒng)應考慮招募和激勵來自不同學科的BRAIN 計劃研究人員的新方法,以服務于BRAIN 計劃之外的研究部分和特別強調(diào)小組,評估與新興BRAIN 計劃技術(shù)相關(guān)的提案。
(3)NIH 應該考慮利用其“全美國研究計劃”,招募由BRAIN 項目資助的人類神經(jīng)科學研究的參與者。
文章來源:
https://braininitiative.nih.gov/sites/default/files/images/brain_2.0_6-6-19-final_revised10302019_508c.pdf
編譯:顧燕婷 羅彧,責任編輯:苗晶良